该杂志刊期列表
- 2026年
- 1期
国内刊号:51-1169/R
国际刊号:1000-1182
发布日期:
作者:杨荣霞, 宗颖睿, 张晨
单位:郑州大学第一附属医院口腔综合科,郑州 450052
关键词:慢性牙周炎,帕金森病,核心基因,转录因子,孟德尔随机化
基金:《口腔种植:治疗计划与临床决策》出版发行
目的 探讨慢性牙周炎(CP)和帕金森病(PD)之间潜在的核心基因、相关通路和转录因子。 方法 从基因表达综合(GEO)数据库下载CP(GSE16134、GSE23586和GSE10334)和PD(GSE20141和GSE49036)的基因表达谱进行差异表达分析、功能聚类分析,并构建蛋白质相互作用(PPI)网络,通过4种拓扑分析算法和模块划分筛选出核心基因,进行转录因子的预测及功能聚类分析。通过CP和PD的外部数据集对核心基因进行验证,并通过双本孟德尔随机化(MR)进一步评估二者的因果关系。 结果 合并数据后,CP数据集共筛选出1 211个差异表达基因(DEG),其中551个上调,660个下调,PD数据集共筛选出2 407个DEG,其中1 438个上调,969个下调;PPI网络包括145个节点和126条边,最终筛选出4个核心基因,分别为FCGR3B、PRF1、IL18和CD33;预测的转录因子包括HSF1、HSF2和HSF4;相关通路主要为自然杀伤细胞(NK)介导的细胞毒性作用;MR结果表明,CP与PD的发病风险可能呈正向因果关系。 结论 本研究探索了CP和PD的潜在共同发病机制及可能的因果关系,为进一步的机制研究提供新思路,预测的转录因子为可能的治疗靶点提供新见解。
来源:2024年第4期
《华西口腔医学》期刊编辑部