华西口腔医学杂志

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:51-1169/R

国际刊号:1000-1182

华西口腔医学杂志2023年第5期:慢性牙周炎与慢性阻塞性肺疾病的潜在共同分子机制及其转录因子初探

发布日期:

作者:张晨, 候珍珍, 宗颖睿

单位:郑州大学第一附属医院口腔预防科,郑州 450052

关键词:慢性牙周炎,慢性阻塞性肺疾病,cross-talk基因,转录因子

目的 探讨慢性牙周炎(CP)和慢性阻塞性肺疾病(COPD)之间潜在的cross-talk基因、相关通路和转录因子。 方法 从GEO数据库下载CP(GSE10334和GSE16134)和COPD(GSE76925)的基因表达谱,进行差异表达分析、功能聚类分析、构建蛋白质相互作用(PPI)网络,通过4种拓扑分析算法和模块划分筛选出核心cross-talk基因,再进行功能聚类分析。 结果 GSE10334共筛选出164个差异表达基因(DEG)(119个上调、45个下调);GSE16134共筛选出208个DEG(154个上调、54个下调);GSE76925共筛选出1 408个DEG(557个上调、851个下调)。PPI网络包括21个节点和20条边。最终筛选出7个核心基因CD79A、FCRLA、CD19、IRF4、CD27、SELL和CXCL13,相关通路为原发性免疫缺陷,B细胞受体信号通路和细胞因子-细胞因子受体相互作用。其得分最高的转录因子为IRF4。 结论 本研究探索了CP和COPD的潜在共同发病机制,其cross-talk基因、相关通路和转录因子可能为进一步的机制研究提供新思路。

来源:2023年第5期

《华西口腔医学》期刊编辑部

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