华西口腔医学杂志

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:51-1169/R

国际刊号:1000-1182

华西口腔医学杂志2022年第6期:基于YTHDC2IGF2BP2HNRNPC的头颈部鳞状细胞癌N6-甲基腺苷风险模型构建及临床应用评估

发布日期:

作者:岳蔷薇, 徐乐, 张东升

单位:山东第一医科大学附属省立医院口腔科,济南 250021

关键词:头颈部鳞状细胞癌,N6-甲基腺苷,预后风险模型,肿瘤免疫微环境,生物信息学分析

基金:山东省自然科学基金面上项目(ZR2021MH353)

目的 利用生物信息学技术构建头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)N6-甲基腺苷(m6A)调节因子模型,进行预后及肿瘤免疫微环境评估。 方法 利用R语言对癌症基因组图谱(TCGA)数据库HNSCC患者进行m6A调节因子风险预后模型构建,然后对不同风险组进行差异基因分析、细胞类型富集分析和临床相关性分析。 结果 HNSCC中15个m6A调节因子表达异常,根据异常表达基因构建了HNSCC YTHDC2、IGF2BP2和HNRNPC三基因独立预后风险模型,其中高风险组免疫抑制相关因子及免疫细胞显著增多,抗肿瘤免疫相关因子及免疫细胞减少,呈现促肿瘤的免疫微环境。 结论 联合YTHDC2、IGF2BP2和HNRNPC的m6A调节因子风险预后模型可以有效评估HNSCC患者预后及肿瘤免疫浸润状态。

来源:2022年第6期

《华西口腔医学》期刊编辑部

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