华西口腔医学杂志

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:51-1169/R

国际刊号:1000-1182

华西口腔医学杂志2020年第6期:基于生物信息学分析的口腔鳞状细胞癌微小RNA预后模型

发布日期:

作者:赵格, 黎昌学, 郭超, 朱慧

单位:石河子大学医学院第一附属医院口腔科,石河子 832000

关键词:口腔鳞状细胞癌,微小RNA,癌症基因组图谱,Cox回归模型,预后模型

基金:石河子大学科研项目(自然科学)(ZZZC201962A)

目的 通过生物信息学筛选并建立与口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者预后相关的微小RNA(miRNA)预后模型,以期对OSCC患者进行精准的分组,提高治疗的针对性。方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载OSCC患者的miRNA、mRNA表达谱和临床数据。采用单因素和多因素Cox风险回归分析筛选和建立miRNA预后模型。受试者工作特征曲线(ROC)和曲线下面积(AUC)检验预后模型的性能。预测6-miRNAs靶基因,与差异mRNA取交集后行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。构建蛋白互作网络(PPI)筛选中枢基因。结果 通过单因素和多因素Cox回归分析得到基于6个miRNA的预后风险模型。train组、test组和所有样品组中预测5年生存率的ROC曲线下AUC值分别为0.757、0.673、0.724。单因素和多因素Cox回归分析显示,6-miRNAs预后模型可以作为一个独立的预后因素(P<0.001)。靶基因构建PPI网络中前10个中枢基因为CCNB1、EGF、KIF23、MCM10、ITGAV、MELK、PLK4、ADCY2、CENPF、TRIP13。其中EGF和ADCY2与生存预后相关(P<0.05)。结论 6-miRNAs可有效地作为OSCC患者一种新的独立的预后模型,或可成为指导OSCC精准治疗的新方法。

来源:2020年第6期

《华西口腔医学》期刊编辑部

查看华西口腔医学杂志2020年第6期

联系我们

  • 地址:成都市人民南路三段14号
  • 电话:(028)85503479
  • E-mail:hxkqyxzz@vip.163.com

咨询工作人员