华西口腔医学杂志

作者：杨利洒,石从郁,梁宇豪,刘曈,侯笑茹,田旭东,王晓毅

单位：口腔疾病研究国家重点实验室 国家口腔疾病临床医学研究中心 四川大学华西口腔医院头颈肿瘤外科,成都 610041

关键词：头颈部鳞癌,生物信息学,程序性死亡配体-1,程序性死亡受体-1

目的 运用生物信息学的方法绘制头颈部鳞癌（HNSCC）中程序性死亡配体-1（PD-L1）共表达基因关系网络,筛选潜在的PD-L1的协同标志物,寻找可能的PD-L1基因调控肿瘤免疫状态的基因和通路。方法 利用癌症和肿瘤基因图谱（TCGA）中的大样本HNSCC的转录组学数据,在cBioPortal数据平台进行基因集的检索,筛选PD-L1共表达基因,在R语言的clusterProfiler中进行GO-BP和KEGG富集分析,再进行分子关系网络分析,提取重要节点基因（hub基因）,再进行生存分析。结果 筛选出共表达基因117个,共表达基因主要富集在免疫调节和病毒反应过程。网络节度分析得到了10个hub基因,依次为STAT1、IFNG、CXCL10、CCR5、FCGR3A、CXCL9、GBP5、CD86、GZMB、IRF1。生存分析显示：CCR5、CXCL9、GZMB是HNSCC预后相关的重要基因。这些基因均参与了免疫过程,其表达与PD-L1相关（Pearson相关系数为0.30、0.35、0.39,P值均小于0.01）。这些基因高表达在HNSCC中均为保护因素。结论 HNSCC中的PD-L1共表达的主要基因均为免疫相关基因,其中CCR5、CXCL9、GZMB与PD-L1存在共表达关系,与预后相关,其可能与程序性死亡受体-1（PD-1）/PD-L1介导的肿瘤免疫逃避相关,为进一步研究PD-1/PD-L1的作用机制和精准靶向治疗提供了新的参考。

来源：2019年第5期

《华西口腔医学》期刊编辑部

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